70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0183 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0183  acetyltransferase  100 
 
 
160 aa  331  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3172  GCN5-related N-acetyltransferase  50.61 
 
 
166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.13673  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  46.75 
 
 
161 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  41.29 
 
 
167 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  42.25 
 
 
193 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
259 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607994  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
166 aa  113  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
185 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.146585  normal  0.318743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
255 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5800  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
280 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.476968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0120  hypothetical protein  40.27 
 
 
164 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.856496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  36.36 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0738  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
177 aa  94.4  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4956  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4985  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
174 aa  91.3  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1452  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
181 aa  82  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3330  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.63 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
195 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00567741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
155 aa  61.6  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
163 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261026  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  32.41 
 
 
176 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  34.44 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4423  acetyltransferase  26.17 
 
 
175 aa  54.3  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0558  putative acetyltransferase  35.48 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.593494  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4463  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
162 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0894462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  28.48 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  27.19 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2832  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003254  probable acetyltransferase  36.84 
 
 
113 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0342  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1650  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000764715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
366 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6269  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785089  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1379  acetyltransferase  35.21 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000349378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.52 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.16 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.67 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.29 
 
 
147 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.09 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5576  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.19 
 
 
147 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5940  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003291  probable acetyltransferase  34.21 
 
 
113 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.83 
 
 
147 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
292 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.93 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  25.93 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.93 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>