106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2187 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  100 
 
 
155 aa  313  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4463  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
145 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
145 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2832  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  36.18 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  36.03 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  37.31 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
141 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.336219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  30.2 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003254  probable acetyltransferase  36.36 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0558  putative acetyltransferase  34.06 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.593494  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09760  acetyltransferase (GNAT) family protein  27.46 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.257332  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1990  acetyltransferase  29.71 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227109  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0919  putative acetyltransferase  32.26 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.240492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
255 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003291  probable acetyltransferase  35.45 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.331512 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  28.26 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5364  acetyltransferase  38.37 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000322188  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1596  acetyltransferase  28.26 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000143194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2620  acetyltransferase  28.26 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000567167  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6022  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000365259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2055  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2098  acetyltransferase  28.26 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3215  acetyltransferase  28.26 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2480  acetyltransferase  29.23 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2534  acetyltransferase  29.23 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1371  acetyltransferase  28.26 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000926886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1221  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
204 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000959318  normal  0.163297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0738  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2074  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000267739  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 
147 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
137 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000111542  hitchhiker  0.00933544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1643  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157541  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
154 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000114873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0183  acetyltransferase  28.48 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
366 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4101  acetyltransferase  38.89 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.945821  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131392  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1957  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000038315  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2128  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4423  acetyltransferase  35.56 
 
 
175 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0894462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0120  hypothetical protein  30.2 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.856496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3172  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.13673  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1376  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000841135  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  25.4 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230129  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4926  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3068  acetyltransferase  26.9 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
164 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3674  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117118  hitchhiker  0.000000840532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313561  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5389  acetyltransferase, GNAT family  28.68 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0801  acetyltransferase  31.4 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.587739  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0538  putative acetyltransferase, putative phage gene  32.65 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261026  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5576  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5940  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6442  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6390  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  37.93 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6547  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.07 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
193 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  24.29 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 
173 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2661  GCN5-related protein N-acetyltransferase  34.85 
 
 
284 aa  43.9  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.320642 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1863  acetyltransferase  24.56 
 
 
251 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.347828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3544  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287849  normal  0.122011 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7224  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0475463  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  25.51 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.694453 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2004  acetyltransferase, GNAT family  25.51 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2487  acetyltransferase  26.14 
 
 
168 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  27.01 
 
 
152 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
171 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2439  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
171 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0342  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.14 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>