52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5389 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5389  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 		 153 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4926  GCN5-related N-acetyltransferase  79.61 
 
 		 157 aa  254  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  62.5 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230129  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7224  GCN5-related N-acetyltransferase  54.05 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0475463  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  56.34 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5940  GCN5-related N-acetyltransferase  52.11 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5576  GCN5-related N-acetyltransferase  52.11 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6442  GCN5-related N-acetyltransferase  51.41 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2128  GCN5-related N-acetyltransferase  47.89 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2511  GCN5-related N-acetyltransferase  49.62 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634797  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131392  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  38.17 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09760  acetyltransferase (GNAT) family protein  38.3 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.257332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0198  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5386  hypothetical protein  94.29 
 
 		 35 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.336219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  33.08 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.331512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0793  putative acetyltransferase  20.59 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.294913  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0921  putative acetyltransferase  20.59 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.335602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  46.03 
 
 		 198 aa  47.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1925  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  28.68 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.11 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4463  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  43.1 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  24.06 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  42.31 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  27.13 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  27.13 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  28.77 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0344  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4201  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.273149  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 431 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  28.38 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0041  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1491  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 		 162 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34088  predicted protein  32.79 
 
 		 183 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>