125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4201 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4201  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
157 aa  320  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.273149  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2417  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 
158 aa  94.4  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000513372  hitchhiker  0.0048595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
162 aa  94  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5539  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0963685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3211  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2926  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.834032  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3889  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000875  acetyltransferase GNAT family  28.7 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  37.35 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2952  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
206 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409535  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4926  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  35.94 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  28.78 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
181 aa  48.5  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432705  normal  0.0282239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5542  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0095  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0938241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0801  acetyltransferase  41.86 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.587739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4188  GCN5-related N-acetyltransferase  44.26 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487702  normal  0.251974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2631  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.512633  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0797  GCN5-related N-acetyltransferase  35.35 
 
 
157 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  28.12 
 
 
178 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
183 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1663  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
159 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2672  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17227  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  24.79 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  27.84 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  28.33 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
188 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12090  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.57 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.769845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
292 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1685  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  44.3  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0101789  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3326  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000236474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0602  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
168 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.047799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3796  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
151 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.583443  hitchhiker  0.000215605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
165 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2682  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
152 aa  43.9  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000369488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  26.6 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0957  putative acetyltransferase  23.13 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0437  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.195322  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003393  histone acetyltransferase HPA2  22.3 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4741  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2412  acetyltransferase  21.5 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02305  N-acetyltransferase  30.67 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
414 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  24.07 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3690  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.74 
 
 
304 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2046  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  25.87 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1998  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  30.77 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1175  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.76 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.193233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2497  GCN5-related protein N-acetyltransferase  29.51 
 
 
289 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455734  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10230  predicted acyltransferase  31.75 
 
 
291 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
170 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3193  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00122797  hitchhiker  0.000000000468815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3198  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
281 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
173 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.055789  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
163 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6442  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
151 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1688  GCN5-related N-acetyltransferase  25.96 
 
 
166 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1670  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
170 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102516  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.23 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.502613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.79 
 
 
162 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3837  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000098197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
208 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34088  predicted protein  34.69 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
148 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5687  GCN5-related N-acetyltransferase  18.64 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5389  acetyltransferase, GNAT family  37.1 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5576  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  27.27 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
197 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5940  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0193  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0431  Prolyl aminopeptidase  24.18 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>