109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1981 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
239 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0925  putative acetyl transferase  46.96 
 
 
236 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2584  GCN5-related N-acetyltransferase  46.96 
 
 
236 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0546703  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
236 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.100489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  41.81 
 
 
241 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0262741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0282  GCN5-related N-acetyltransferase  42.92 
 
 
245 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0120  GCN5-related N-acetyltransferase  38.5 
 
 
241 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.551401  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3208  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  31.6 
 
 
252 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  40.82 
 
 
477 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2290  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  29.37 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
254 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3732  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
289 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.311984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 
146 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2014  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
173 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
345 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  37.7 
 
 
146 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
412 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10739  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.03 
 
 
139 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3976  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
147 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1368  acyltransferase protein  39.33 
 
 
177 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
173 aa  48.5  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  46.55 
 
 
162 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3427  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2689  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  36.21 
 
 
148 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
320 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.47892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
147 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  24.7 
 
 
251 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
429 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  40.68 
 
 
161 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  42.42 
 
 
891 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3663  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
162 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  32.47 
 
 
163 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4620  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  43.66 
 
 
167 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  36.76 
 
 
151 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2497  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.19 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455734  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
139 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4510  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
204 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0032578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1723  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  34.29 
 
 
145 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.173475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 
268 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1542  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  34.29 
 
 
145 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
175 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
177 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  38.98 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  38.98 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1400  acetyltransferase  36.21 
 
 
171 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0380  acetyltransferase  21.48 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.335252  hitchhiker  0.000000351254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6006  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.28 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.132582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
143 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5375  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
159 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173903  normal  0.430814 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0335  acetyltransferase  40 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.793507  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1733  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  32.86 
 
 
145 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1797  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  32.86 
 
 
145 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1736  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  32.86 
 
 
145 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.771756  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157687  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  45.9 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4707  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0617246  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02240  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.78 
 
 
781 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.07 
 
 
147 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
167 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4829  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  34.78 
 
 
147 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.9 
 
 
152 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
381 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0868  ribosomal-protein-S18-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
145 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1148  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
145 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.16 
 
 
160 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.76 
 
 
157 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0467  GCN5-like N-acetyltransferase  29.67 
 
 
187 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
139 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  29.07 
 
 
363 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3602  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
195 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23036 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0938  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.85 
 
 
176 aa  43.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
295 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4201  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
157 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.273149  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1241  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.45 
 
 
175 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73573  normal  0.88408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
153 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  24.6 
 
 
164 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
157 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0181  metalloendopeptidase, glycoprotease family  39.34 
 
 
832 aa  42.7  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0811  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  45.76 
 
 
147 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.11 
 
 
153 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  34.78 
 
 
147 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  36.67 
 
 
167 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  36.67 
 
 
167 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
167 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3210  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  32.86 
 
 
150 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.938022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>