229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3602 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3602  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
195 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2920  GCN5-related N-acetyltransferase  39.07 
 
 
152 aa  89  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.481463  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  44.09 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1761  putatative acetyltransferase  39.1 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389085  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4181  GCN5-related N-acetyltransferase  47.56 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20491  putatative acetyltransferase  42.25 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0667747  normal  0.264372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3853  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0929  putative acetyltransferase  29.05 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8955  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316423  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
153 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1821  hypothetical protein  34.91 
 
 
151 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0191  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase  29.08 
 
 
269 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1530  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
157 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.839822  normal  0.716536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 
152 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6158  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0997895  normal  0.166229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1706  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
146 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.18989  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1783  acetyltransferase  31.21 
 
 
153 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5542  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
152 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3241  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
150 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.519262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46600  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
150 aa  58.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.395219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0265  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
160 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1725  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
154 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105748  normal  0.188716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0052  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
149 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4793  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1544  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
163 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.405729 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  25.18 
 
 
149 aa  55.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34630  acetyltransferase  31.82 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 
136 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01508  hypothetical protein  29.25 
 
 
151 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3286  acetyltransferase  32.14 
 
 
149 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.867207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  28.47 
 
 
153 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  31.15 
 
 
147 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  31.15 
 
 
147 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5485  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
153 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194088  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  27.97 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4002  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  26.36 
 
 
148 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3797  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
166 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4257  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
147 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106946  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3909  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
156 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
239 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3886  hypothetical protein  36.3 
 
 
148 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.680311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
150 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
166 aa  51.2  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
162 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2639  acetyltransferase  30.69 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0724929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  26.53 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2335  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
146 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00213178  normal  0.015977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  37.86 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12090  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.07 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.769845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2000  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.744439  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.502613  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3790  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.195519  normal  0.0197578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2150  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
166 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3796  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.583443  hitchhiker  0.000215605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  27.97 
 
 
164 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1439  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.933106  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  32.18 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
320 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0830  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2155  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
152 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5687  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
157 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157687  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3628  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
154 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0436  acetyltransferase  30.37 
 
 
153 aa  48.5  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
144 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
314 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0946  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
149 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2756  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5358  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  34.74 
 
 
364 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5283  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
143 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0999  acetyltransferase  30.68 
 
 
143 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0121067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2127  N-acetyltransferase  29.79 
 
 
157 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2046  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
149 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1218  acetyltransferase  29.41 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.065696  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
154 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1344  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000016688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  25.61 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003393  histone acetyltransferase HPA2  24 
 
 
158 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.48 
 
 
139 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1883  acetyltransferase  23.53 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
149 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  23.53 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00776574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  31.4 
 
 
148 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  23.28 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  27.47 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>