60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3760 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
320 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.47892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4142  GCN5-related N-acetyltransferase  86.48 
 
 
320 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5311  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
311 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
345 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  42.53 
 
 
261 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1137  GCN5-related N-acetyltransferase  36.83 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3208  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
246 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  40.42 
 
 
236 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4408  GCN5-related N-acetyltransferase  36.92 
 
 
349 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.469823  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
312 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
296 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353174  hitchhiker  0.0086157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0558  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
296 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  37.13 
 
 
277 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  38.02 
 
 
412 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10739  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3732  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
289 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.311984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
342 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
295 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  37.45 
 
 
269 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000110106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 
252 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
253 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2290  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
264 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1191  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  31.95 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10433  hypothetical protein  33.6 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.243356  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1940  acetyltransferase  28.8 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  32.86 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  35.32 
 
 
418 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1867  acetyltransferase  28 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.968851  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 
250 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.641949  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
250 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5596  GCN5-related N-acetyltransferase  32.07 
 
 
274 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697778  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
256 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  30.8 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 
147 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3977  acetyltransferase  26.4 
 
 
267 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.100489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
139 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10971  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.61 
 
 
131 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0263282  normal  0.176049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0282  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
245 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1382  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
157 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2584  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
236 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0546703  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14911  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.51 
 
 
151 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
213 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0925  putative acetyl transferase  27.5 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
175 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  33.77 
 
 
167 aa  42.7  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1485  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
149 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>