More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1942 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
139 aa  287  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  68.84 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  60.87 
 
 
139 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  63.04 
 
 
138 aa  176  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  56.12 
 
 
139 aa  173  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  56.83 
 
 
139 aa  167  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  54.35 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  53.62 
 
 
145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  54.35 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  52.9 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  52.17 
 
 
141 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  52.17 
 
 
141 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  52.17 
 
 
141 aa  158  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  51.8 
 
 
141 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  51.8 
 
 
141 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  51.8 
 
 
141 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  51.8 
 
 
141 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  51.8 
 
 
141 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  51.45 
 
 
141 aa  155  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  50.36 
 
 
162 aa  154  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  50.36 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  50.36 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  50.36 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  50.36 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  50.36 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  50.36 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  50.36 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  50.36 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  50.36 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  48.55 
 
 
157 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3140  putative acetyltransferase  47.83 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0451024  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  46.67 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2385  putative acetyltransferase  47.41 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.110426  normal  0.478401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  47.83 
 
 
153 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28630  acetyltransferase  50 
 
 
154 aa  123  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319121  normal  0.0687549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2517  putative acetyltransferase  42.55 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1881  putative acetyltransferase  42.55 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2492  putative acetyltransferase  42.55 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0803  putative acetyltransferase  41.96 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.711368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1968  putative acetyltransferase  45.45 
 
 
156 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000689442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0945  putative acetyltransferase  45.45 
 
 
152 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0880  putative acetyltransferase  45.45 
 
 
152 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0988  putative acetyltransferase  45.45 
 
 
156 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000423177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0995  putative acetyltransferase  45.45 
 
 
156 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0756799  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0268  putative acetyltransferase  45.45 
 
 
156 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0790  putative acetyltransferase  46.1 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1149  putative acetyltransferase  45.45 
 
 
156 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0150851  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2169  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
150 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0666811  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2539  putative acetyltransferase  41.84 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2410  putative acetyltransferase  41.84 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5824  putative acetyltransferase  41.13 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3264  putative acetyltransferase  44.19 
 
 
150 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172457  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  41.48 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0154412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  47.01 
 
 
155 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4323  putative acetyltransferase  43.9 
 
 
148 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3573  acetyltransferase, GNAT family  39.39 
 
 
154 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  42.86 
 
 
146 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22510  Acetyltransferase, GNAT family  36.88 
 
 
159 aa  97.1  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.919154  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.16 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000283618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4207  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12020  N-acetyltransferase (GNAT) family  34.59 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536123  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  30.4 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0276  acetyltransferase  28.68 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0223  acetyltransferase  27.91 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
291 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.59 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003177  acetyltransferase  32.48 
 
 
138 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0250  acetyltransferase  27.13 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5170  hypothetical protein  35 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.06 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.21 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1286  putative acetyltransferase YpeA, truncation  44.23 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58830  hypothetical protein  32.77 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.144795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0348  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.87 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.78 
 
 
154 aa  57  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00104709  normal  0.101966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3761  AAA ATPase central domain protein  30.37 
 
 
438 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.53 
 
 
166 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3981  ATPase central domain-containing protein  29.63 
 
 
471 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0440  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2174  acetyltransferase  28.21 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00703282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.62 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  31.07 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0689  acetyltransferase  30.41 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00474298  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
367 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16600  N-acetylglutamate synthase  25.35 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.03 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2724  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.33727  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7255  GCN5-related N-acetyltransferase  33.6 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.5 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1644  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
247 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.796176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  35.71 
 
 
369 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.65 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6455  GCN5-related N-acetyltransferase  33.6 
 
 
176 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>