More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0758 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  100 
 
 
145 aa  296  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  98.62 
 
 
145 aa  294  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  91.49 
 
 
141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  90.07 
 
 
141 aa  269  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  87.23 
 
 
141 aa  258  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  87.23 
 
 
141 aa  258  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  87.23 
 
 
141 aa  258  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  87.23 
 
 
141 aa  256  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  80.56 
 
 
162 aa  250  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  246  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  246  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  246  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  246  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  82.27 
 
 
141 aa  246  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  246  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  82.27 
 
 
141 aa  246  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  81.56 
 
 
141 aa  244  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  81.56 
 
 
141 aa  244  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  53.62 
 
 
139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  54.35 
 
 
139 aa  160  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  52.11 
 
 
157 aa  146  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  48.92 
 
 
139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
139 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  48.89 
 
 
138 aa  135  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  47.1 
 
 
141 aa  127  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2385  putative acetyltransferase  45.65 
 
 
151 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.110426  normal  0.478401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28630  acetyltransferase  46.62 
 
 
154 aa  120  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319121  normal  0.0687549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  45.07 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3140  putative acetyltransferase  41.38 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0451024  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  41.26 
 
 
157 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3264  putative acetyltransferase  45.24 
 
 
150 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172457  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2517  putative acetyltransferase  40.28 
 
 
151 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1881  putative acetyltransferase  40.28 
 
 
151 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2492  putative acetyltransferase  40.28 
 
 
151 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  43.8 
 
 
146 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5824  putative acetyltransferase  39.58 
 
 
151 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2410  putative acetyltransferase  39.58 
 
 
151 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0790  putative acetyltransferase  42.66 
 
 
152 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
136 aa  101  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2169  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 
150 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0666811  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2539  putative acetyltransferase  40.29 
 
 
155 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0803  putative acetyltransferase  38.89 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.711368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1968  putative acetyltransferase  41.26 
 
 
156 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000689442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0268  putative acetyltransferase  41.26 
 
 
156 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0988  putative acetyltransferase  41.26 
 
 
156 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000423177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0995  putative acetyltransferase  41.26 
 
 
156 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0756799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1149  putative acetyltransferase  41.26 
 
 
156 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0150851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0945  putative acetyltransferase  41.26 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0880  putative acetyltransferase  41.26 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  41.04 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0154412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4323  putative acetyltransferase  37.5 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22510  Acetyltransferase, GNAT family  37.41 
 
 
159 aa  94.7  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.919154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1286  putative acetyltransferase YpeA, truncation  80 
 
 
55 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3573  acetyltransferase, GNAT family  37.21 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0223  acetyltransferase  37.93 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0250  acetyltransferase  37.93 
 
 
148 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0276  acetyltransferase  37.07 
 
 
148 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000283618  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  32.14 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2724  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.33727  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0802  putative acetyltransferase  34.38 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
291 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2174  acetyltransferase  32.76 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00703282  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4207  GCN5-related N-acetyltransferase  37.07 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003177  acetyltransferase  36.75 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0440  GCN5-related N-acetyltransferase  30.33 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16600  N-acetylglutamate synthase  28.8 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.82 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8909  putative acetyltransferase  30.63 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7255  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.87 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.9 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
364 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  30.61 
 
 
363 aa  58.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12020  N-acetyltransferase (GNAT) family  35.14 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  27.34 
 
 
369 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.48 
 
 
176 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58830  hypothetical protein  31.48 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.144795 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5170  hypothetical protein  27.5 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  29.55 
 
 
364 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.47 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 
382 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  34.13 
 
 
595 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.94 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
364 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.81 
 
 
160 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
593 aa  53.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.23 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>