More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3397 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
139 aa  290  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  60.87 
 
 
139 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  61.59 
 
 
157 aa  173  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  57.97 
 
 
139 aa  170  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  57.97 
 
 
138 aa  166  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  51.45 
 
 
139 aa  158  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  48.92 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  48.92 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  48.92 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  49.64 
 
 
145 aa  147  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  49.64 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  48.92 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  47.48 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  47.48 
 
 
141 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  46.76 
 
 
162 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  48.2 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28630  acetyltransferase  54.33 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319121  normal  0.0687549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  53.33 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3140  putative acetyltransferase  46.43 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0451024  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  46.38 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  45.71 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2385  putative acetyltransferase  48.89 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.110426  normal  0.478401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  45.71 
 
 
153 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
143 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0154412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4323  putative acetyltransferase  50.41 
 
 
148 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2169  GCN5-related N-acetyltransferase  47.41 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0666811  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3264  putative acetyltransferase  48.82 
 
 
150 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172457  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0790  putative acetyltransferase  44.06 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  43.61 
 
 
146 aa  110  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2517  putative acetyltransferase  41.84 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1881  putative acetyltransferase  41.84 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2492  putative acetyltransferase  41.84 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1968  putative acetyltransferase  44.76 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000689442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0988  putative acetyltransferase  44.76 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000423177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0995  putative acetyltransferase  44.76 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0756799  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0268  putative acetyltransferase  44.76 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0945  putative acetyltransferase  44.76 
 
 
152 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0880  putative acetyltransferase  44.76 
 
 
152 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000172185  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1149  putative acetyltransferase  44.76 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0150851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2410  putative acetyltransferase  41.13 
 
 
151 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2539  putative acetyltransferase  41.73 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 
136 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0803  putative acetyltransferase  42.86 
 
 
151 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.711368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3573  acetyltransferase, GNAT family  42.19 
 
 
154 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5824  putative acetyltransferase  39.72 
 
 
151 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22510  Acetyltransferase, GNAT family  32.37 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.919154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000283618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12020  N-acetyltransferase (GNAT) family  31.58 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536123  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  30.94 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2174  acetyltransferase  32.77 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00703282  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1286  putative acetyltransferase YpeA, truncation  49.06 
 
 
55 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5170  hypothetical protein  31.5 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00104709  normal  0.101966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  37.08 
 
 
364 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
364 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003177  acetyltransferase  31.03 
 
 
138 aa  57.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0440  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58830  hypothetical protein  28.33 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.144795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2724  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.33727  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0802  putative acetyltransferase  29.69 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8254  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  42.42 
 
 
314 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  34.26 
 
 
295 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0995  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
179 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477492  normal  0.167483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0971  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4030  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01975  acetyltransferase  32.32 
 
 
217 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0699749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.46 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
168 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0893  hypothetical protein  44.07 
 
 
337 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  35.48 
 
 
369 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4207  GCN5-related N-acetyltransferase  27.2 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0189  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.46 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  44.26 
 
 
297 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  26.5 
 
 
291 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.6 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
382 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7255  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
142 aa  47.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0811  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.05 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1941  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0276  acetyltransferase  25.2 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.05 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>