209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28630  acetyltransferase  100 
 
 
154 aa  303  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319121  normal  0.0687549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  62.22 
 
 
141 aa  160  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3264  putative acetyltransferase  56.3 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172457  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  54.33 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2385  putative acetyltransferase  50.35 
 
 
151 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.110426  normal  0.478401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  55.07 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2169  GCN5-related N-acetyltransferase  48.12 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0666811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
139 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4323  putative acetyltransferase  46.67 
 
 
148 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  45.11 
 
 
141 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  45.11 
 
 
141 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  45.11 
 
 
141 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  46.62 
 
 
145 aa  120  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  45.11 
 
 
141 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  46.72 
 
 
138 aa  120  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  45.11 
 
 
141 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  45.11 
 
 
141 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  45.11 
 
 
141 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  45.11 
 
 
141 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  43.15 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  53.51 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  44.36 
 
 
141 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  45.86 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  49.21 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  43.7 
 
 
139 aa  116  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  43.61 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  45.11 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  44.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  44.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  44.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  44.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  44.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  44.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  44.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  44.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  44.36 
 
 
141 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  49.24 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0154412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  41.89 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  42.66 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3140  putative acetyltransferase  41.26 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0451024  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3573  acetyltransferase, GNAT family  36.92 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1968  putative acetyltransferase  42.75 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000689442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1149  putative acetyltransferase  42.75 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0150851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0988  putative acetyltransferase  42.75 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000423177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0995  putative acetyltransferase  42.75 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0756799  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0268  putative acetyltransferase  42.75 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0945  putative acetyltransferase  42.75 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0880  putative acetyltransferase  42.75 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000172185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2517  putative acetyltransferase  38.17 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1881  putative acetyltransferase  38.17 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2492  putative acetyltransferase  38.17 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0790  putative acetyltransferase  41.98 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22510  Acetyltransferase, GNAT family  36.69 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.919154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0803  putative acetyltransferase  38.97 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.711368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2539  putative acetyltransferase  37.4 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2410  putative acetyltransferase  37.4 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5824  putative acetyltransferase  38.53 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000283618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2174  acetyltransferase  36.08 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00703282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7255  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  34.73 
 
 
295 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16600  N-acetylglutamate synthase  31.39 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003177  acetyltransferase  42.25 
 
 
138 aa  57.4  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  31.01 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
291 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.8 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12020  N-acetyltransferase (GNAT) family  30.66 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536123  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2724  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.33727  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0802  putative acetyltransferase  31.4 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5170  hypothetical protein  29.69 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
253 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1286  putative acetyltransferase YpeA, truncation  48.84 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  52.17 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58830  hypothetical protein  28.91 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.144795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
291 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0297  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0502294  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.69 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0440  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.4 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0893  hypothetical protein  39.47 
 
 
337 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  44.23 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  47.83 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157687  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0191  acetyltransferase  28.03 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1149  acetyltransferase  30.77 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4207  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.2 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0995  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477492  normal  0.167483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8909  putative acetyltransferase  32.77 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0460  putative acetyltransferase  37.5 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0457  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
310 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.78 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2347  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.820631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2026  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
327 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>