251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2515 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
270 aa  544  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  56.56 
 
 
268 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  56.56 
 
 
268 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3977  acetyltransferase  57.79 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
257 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  46.4 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1940  acetyltransferase  45.12 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1867  acetyltransferase  44.72 
 
 
252 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.968851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10739  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4408  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.469823  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3208  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  30.8 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
312 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  30.62 
 
 
250 aa  62  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.641949  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353174  hitchhiker  0.0086157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  30 
 
 
477 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2290  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000110106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4142  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0558  GCN5-related N-acetyltransferase  27.24 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.64 
 
 
162 aa  60.1  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  43.06 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3788  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
187 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1342  acetyltransferase  38.46 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0732306  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1153  acetyltransferase domain-containing protein  40.98 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  29.36 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1191  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.47892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  29.96 
 
 
418 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
164 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 
142 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 
182 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2189  GCN5-related N-acetyltransferase  31.53 
 
 
204 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.37 
 
 
146 aa  50.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.66 
 
 
156 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  48.33 
 
 
147 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268172  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1341  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
152 aa  49.7  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1376  GCN5-related N-acetyltransferase  42.19 
 
 
154 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000841135  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1941  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
153 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 
174 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.266157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2567  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.29 
 
 
159 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.203985  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3732  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
289 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.311984  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03382  hypothetical protein  39.06 
 
 
144 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2663  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.29 
 
 
159 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.5 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.5 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.5 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  48.89 
 
 
167 aa  48.9  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.5 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002624  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  40 
 
 
151 aa  48.9  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.5 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.5 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0760  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.67 
 
 
170 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.757602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000111542  hitchhiker  0.00933544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2212  putative acetyltransferase  38.32 
 
 
160 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0188  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.61 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1643  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
173 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157541  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1970  GCN5-related N-acetyltransferase  41.79 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
188 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1349  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.04 
 
 
148 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.67 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5170  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
196 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1530  acetyltransferase  38.89 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.02 
 
 
153 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3332  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
196 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0887  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  47.89 
 
 
160 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14178  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2474  acetyltransferase  43.24 
 
 
164 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0151446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
164 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.25 
 
 
150 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  52.17 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1293  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
159 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.489062  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.33 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  32.08 
 
 
141 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2145  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.33 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299781  hitchhiker  0.00179484 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1148  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
145 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3447  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.04 
 
 
147 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0022  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
164 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.545701 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0868  ribosomal-protein-S18-alanine acetyltransferase  40 
 
 
145 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
139 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2256  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32 
 
 
148 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.29 
 
 
166 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.27 
 
 
153 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.66 
 
 
147 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1494  putative acetyltransferase  40.68 
 
 
167 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0011  streptothricin acetyltransferase  31.25 
 
 
180 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4774  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
225 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3393  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
225 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1242  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.71 
 
 
163 aa  46.6  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4510  GCN5-related N-acetyltransferase  45.61 
 
 
204 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0032578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>