35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0925 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0925  putative acetyl transferase  100 
 
 
236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2584  GCN5-related N-acetyltransferase  99.15 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0546703  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  75.85 
 
 
236 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.100489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0120  GCN5-related N-acetyltransferase  47.6 
 
 
241 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.551401  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  46.81 
 
 
241 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0262741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0282  GCN5-related N-acetyltransferase  44.54 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  46.96 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  30.89 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  26.05 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  24.22 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  29.26 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  29.74 
 
 
477 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2290  GCN5-related N-acetyltransferase  28.02 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
315 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
412 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10739  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  39.71 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
345 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.1 
 
 
139 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  43.55 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
152 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  47.54 
 
 
277 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  24.36 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  28.02 
 
 
250 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.641949  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4620  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  39.44 
 
 
167 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3941  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  39.44 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3290  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.44 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  24.36 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  28.97 
 
 
166 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3845  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.03 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  26.38 
 
 
271 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000110106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3977  acetyltransferase  26.07 
 
 
267 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>