182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3977 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3977  acetyltransferase  100 
 
 		 267 aa  544  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  63.71 
 
 		 268 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  62.11 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  57.79 
 
 		 270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  46.8 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  46.53 
 
 		 257 aa  231  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1940  acetyltransferase  44.27 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1867  acetyltransferase  45.31 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.968851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3208  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4408  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.469823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10739  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.13 
 
 		 149 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  28.11 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.22 
 
 		 161 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.641949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  39.36 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2290  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  26.58 
 
 		 477 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  36.08 
 
 		 164 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0612  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.79 
 
 		 148 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1153  acetyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  50 
 
 		 156 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1342  acetyltransferase  32.1 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0732306  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.11 
 
 		 146 aa  52.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 		 160 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 418 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  26.69 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000110106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08970  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.89 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1191  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6006  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.24 
 
 		 185 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.132582 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1530  acetyltransferase  31.46 
 
 		 162 aa  50.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38.98 
 
 		 166 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.88 
 
 		 162 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 168 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 		 154 aa  49.3  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3134  acetyltransferase  29.82 
 
 		 411 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0736  acetyltransferase  29.82 
 
 		 411 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1376  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 154 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000841135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0436  acetyltransferase  33.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3325  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.85 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0967  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1643  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 		 173 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157541  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0433  acetyltransferase  41.67 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.03 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000111542  hitchhiker  0.00933544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.28 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.04 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1957  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000038315  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1975  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.19 
 
 		 152 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000114873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2064  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.27 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353174  hitchhiker  0.0086157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4203  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.814573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0558  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002624  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  41.67 
 
 		 151 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 		 174 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0339934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  37.04 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0938  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.51 
 
 		 176 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0022  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 		 164 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.545701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4703  GCN5-related N-acetyltransferase  45.16 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.625988 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0103  acetyltransferase  29.82 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.864372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1486  acetyltransferase  29.82 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0958  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36 
 
 		 173 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452906 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2915  acetyltransferase  29.82 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.79 
 
 		 147 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 		 164 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.65 
 
 		 165 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.52 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  52.5 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03382  hypothetical protein  38.46 
 
 		 144 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.92 
 
 		 139 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5311  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 147 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1401  acetyltransferase, GNAT family  46.3 
 
 		 192 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000159569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  42.19 
 
 		 141 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.44 
 
 		 205 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659195  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0887  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.58 
 
 		 160 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3157  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.77 
 
 		 145 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3942  acetyltransferase, GNAT family  46.3 
 
 		 192 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000096173  decreased coverage  0.00543726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>