77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_08970  acetyltransferase (GNAT) family protein  100 
 
 
262 aa  521  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298365  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  53.25 
 
 
247 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5596  GCN5-related N-acetyltransferase  50.41 
 
 
274 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697778  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4408  GCN5-related N-acetyltransferase  37.98 
 
 
349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.469823  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  36.33 
 
 
412 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10739  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  37.35 
 
 
477 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  35.02 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3208  GCN5-related N-acetyltransferase  34.02 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 
236 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
271 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000110106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2290  GCN5-related N-acetyltransferase  30.74 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1137  GCN5-related N-acetyltransferase  34.32 
 
 
350 aa  78.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4142  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3977  acetyltransferase  30.89 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  34.45 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.47892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  30.42 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5311  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_004310  BR1940  acetyltransferase  29.69 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1867  acetyltransferase  30.23 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.968851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3732  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.311984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0558  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353174  hitchhiker  0.0086157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  30.7 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  29.47 
 
 
241 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0262741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  44.16 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  30.04 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  27.31 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  30.04 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  36.27 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
147 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3544  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  40.3 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
144 aa  48.9  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
315 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
114 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242701  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 
168 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.34 
 
 
139 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28 
 
 
151 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1153  acetyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1191  GCN5-related N-acetyltransferase  44.87 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.97 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5496  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
186 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334884  normal  0.121728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  24.19 
 
 
153 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0017  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0633142  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.641949  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1342  acetyltransferase  27.27 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0732306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
166 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
429 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2256  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.36 
 
 
148 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30849  predicted protein  39.39 
 
 
210 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0149244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  35.59 
 
 
186 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30 
 
 
148 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2470  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.59 
 
 
130 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000909286  normal  0.30524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4649  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
169 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4734  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581977  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1189  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
145 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0597607  normal  0.666757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2597  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.32 
 
 
165 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
174 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0925  putative acetyl transferase  30.77 
 
 
236 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.81 
 
 
148 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  32.1 
 
 
109 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2761  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30 
 
 
274 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.30165  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3710  acetyltransferase, GNAT family  30.99 
 
 
184 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>