59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4408 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4408  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 349 aa  669    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.469823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  55.77 
 
 		 412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10739  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  37.85 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  37.6 
 
 		 236 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.47892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2290  GCN5-related N-acetyltransferase  35.89 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3208  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  34.96 
 
 		 252 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  30.04 
 
 		 257 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  34.73 
 
 		 477 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4142  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 253 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5596  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 		 274 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697778  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  33.07 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000110106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  33.21 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  33.21 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5311  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3977  acetyltransferase  27.41 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1940  acetyltransferase  27.52 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1137  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08970  acetyltransferase (GNAT) family protein  38.43 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1867  acetyltransferase  27.13 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.968851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  31.25 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0558  GCN5-related N-acetyltransferase  29.62 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  33.21 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  29.15 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353174  hitchhiker  0.0086157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.641949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3732  GCN5-related N-acetyltransferase  29.39 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.311984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 250 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5753  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3927  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 		 179 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5520  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.890921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0282  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 		 147 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3764  GCN5-related N-acetyltransferase  34.17 
 
 		 169 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1751  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  37.5 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 		 160 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4359  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 208 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 181 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>