39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5753 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5753  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5520  GCN5-related N-acetyltransferase  93.82 
 
 
259 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.890921  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0369  GCN5-related N-acetyltransferase  38.28 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1239  acetyltransferase  33.08 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2761  GCN5-related protein N-acetyltransferase  26.72 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.30165  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0134  acetyltransferase  33.08 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1562  acetyltransferase  33.08 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1643  acetyltransferase  33.08 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0569  acetyltransferase  28.33 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0553  acetyltransferase  28.33 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2915  acetyltransferase  28.33 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1486  acetyltransferase  28.33 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0103  acetyltransferase  28.33 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.864372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3134  acetyltransferase  27.9 
 
 
411 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0736  acetyltransferase  29.18 
 
 
411 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1854  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.794168  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
315 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0682  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
269 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.341989  normal  0.410017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0607  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
318 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0460  acetyltransferase  31.58 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4408  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.469823  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
300 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
129 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3997  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  28.09 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8386  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8275  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27325  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2106  hypothetical protein  21.37 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1945  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0119  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5987  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
156 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0718  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
149 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7312  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1863  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
418 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10841  hypothetical protein  26.47 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2180  acetyltransferase, GNAT family protein  27.96 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>