69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3186 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
160 aa  323  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230129  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5389  acetyltransferase, GNAT family  62.5 
 
 
153 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4926  GCN5-related N-acetyltransferase  59.15 
 
 
157 aa  173  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7224  GCN5-related N-acetyltransferase  54.11 
 
 
161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0475463  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  49.68 
 
 
157 aa  150  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5940  GCN5-related N-acetyltransferase  48.65 
 
 
151 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5576  GCN5-related N-acetyltransferase  48.65 
 
 
151 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6442  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
151 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
157 aa  110  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131392  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2128  GCN5-related N-acetyltransferase  43.84 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09760  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.66 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.257332  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2511  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
175 aa  94.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634797  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0198  GCN5-related N-acetyltransferase  39.85 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  30.82 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5386  hypothetical protein  79.41 
 
 
35 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
145 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  38.36 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2832  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  25.4 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1740  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609164  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  24.41 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.331512 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  27.45 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  27.2 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3326  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
237 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.22 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.68 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000497288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  25.6 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6394  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423137  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  35.62 
 
 
299 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0120  hypothetical protein  23.74 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.856496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
291 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  25.35 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.336219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6269  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785089  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4266  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2002  putative acetyltransferase  40.66 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3229  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.66 
 
 
165 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2464  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.66 
 
 
165 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2083  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.66 
 
 
165 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0325128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2520  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.66 
 
 
165 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710408  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.66 
 
 
165 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408261  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1356  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.66 
 
 
165 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0397036  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  41.27 
 
 
213 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.41 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2609  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.66 
 
 
491 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.93 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2371  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34088  predicted protein  31.15 
 
 
183 aa  40.8  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1925  GCN5-related N-acetyltransferase  26.58 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516117  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
259 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607994  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  32.18 
 
 
215 aa  40.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
200 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1364  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.16 
 
 
164 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>