160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3674 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3674  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 143 aa  291  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117118  hitchhiker  0.000000840532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4101  acetyltransferase  88.81 
 
 		 147 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.945821  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  87.41 
 
 		 147 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  76.92 
 
 		 143 aa  230  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3068  acetyltransferase  45.32 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000114873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1221  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000959318  normal  0.163297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1376  GCN5-related N-acetyltransferase  35.2 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000841135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1957  GCN5-related N-acetyltransferase  34.96 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000038315  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000111542  hitchhiker  0.00933544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1643  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157541  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5364  acetyltransferase  33.59 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000322188  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2074  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000267739  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6022  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000365259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2055  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000246116  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0538  putative acetyltransferase, putative phage gene  28.06 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33979  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1596  acetyltransferase  33.61 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000143194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2620  acetyltransferase  33.61 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000567167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2098  acetyltransferase  33.61 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3215  acetyltransferase  33.61 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1371  acetyltransferase  33.61 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000926886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1990  acetyltransferase  32.79 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2480  acetyltransferase  33.61 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2534  acetyltransferase  33.61 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0919  putative acetyltransferase  32.31 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.240492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1849  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027966  hitchhiker  0.0000116121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1904  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000132794  hitchhiker  0.0000000182782 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2129  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115356  hitchhiker  0.000216596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.909568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.108935  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3407  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  31.82 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  25.78 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  38.89 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09760  acetyltransferase (GNAT) family protein  34.44 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.257332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0198  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3172  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.13673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0223271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6442  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1048  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.88 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.070791  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5576  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5940  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0227912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  34.86 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1899  acyltransferase  29.76 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.627719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  23.21 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.88 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2178  acetyltransferase  29.76 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.490627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1910  acetyltransferase  29.76 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0595926  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  36 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0207  TDP-fucosamine acetyltransferase  33.64 
 
 		 240 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.46 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3193  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00122797  hitchhiker  0.000000000468815 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2192  acyltransferase  38.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.419668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2083  acetyltransferase  38.6 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0558  putative acetyltransferase  26.74 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.593494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7224  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0475463  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0986  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.34 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06700  acetyltransferase  41.77 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.88 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3222  acetyltransferase  30.95 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.74 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2877  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  30.12 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 		 366 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2850  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0628  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.48 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  38.57 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2832  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 255 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  41.82 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.945027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00606  Histone acetyltransferase HPA2/related acetyltransferase  24.14 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4463  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0298  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5806  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.986614  normal  0.529304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4926  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1395  GCN5-related N-acetyltransferase  44.62 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22834  hitchhiker  0.000414904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.62 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>