210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0171 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  95.92 
 
 
147 aa  294  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  95.89 
 
 
147 aa  291  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0223271  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0192  acetyltransferase  81.63 
 
 
147 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0169  GCN5-related N-acetyltransferase  79.31 
 
 
147 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4085  GCN5-related N-acetyltransferase  77.93 
 
 
147 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0173  GCN5-related N-acetyltransferase  77.78 
 
 
147 aa  235  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  76.55 
 
 
147 aa  234  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  73.79 
 
 
147 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0131  GCN5-related N-acetyltransferase  55 
 
 
151 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4344  GCN5-related N-acetyltransferase  55.32 
 
 
148 aa  153  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.333923  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  51.47 
 
 
153 aa  150  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0227912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
153 aa  150  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  47.18 
 
 
144 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  46.67 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0185  putative acetyltransferase  44.6 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1418  putative acetyltransferase  39.31 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1941  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.08 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.25 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.61 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.51 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1322  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.97 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.37 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4787  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.97 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126445  normal  0.618144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.46 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0227  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.97 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.03 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.52 
 
 
171 aa  57  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00273276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.39 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.66 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.54 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.29 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.85 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000661425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.47 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.469186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.58 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.94 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6006  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.99 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.132582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
381 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.97 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2087  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.27 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.279688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2124  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.27 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0799  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.03 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.73 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  30.26 
 
 
373 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0563  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.81 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0974186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1178  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.34 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.165721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0792  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
294 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61880  peptide n-acetyltransferase RimI  27.52 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355527  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.37 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.32 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5385  peptide n-acetyltransferase RimI  27.52 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2362  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.41 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  33.72 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.66 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  25.52 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1763  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.48 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.37 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0060  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
361 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.461775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3852  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.88 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  25 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.03 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  26.32 
 
 
147 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2437  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
148 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
148 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0491515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0884  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.86 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6703  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.82 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3013  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
323 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.624033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0936  GCN5-related N-acetyltransferase  28.72 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.256196 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.14 
 
 
147 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3829  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1458  hypothetical protein  26.28 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1525  hypothetical protein  26.28 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
366 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.38 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.79 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.54 
 
 
371 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.59 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.85 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0647  GCN5-related N-acetyltransferase  36.04 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.87 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1944  GCN5-related N-acetyltransferase  22.09 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.589502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.2 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.47 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  34.12 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  25.9 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0587  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.29 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>