More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2527 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
382 aa  784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  66.3 
 
 
367 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  65.19 
 
 
365 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  65.19 
 
 
365 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  61.5 
 
 
364 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  60.66 
 
 
364 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  89.06 
 
 
194 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  48.07 
 
 
368 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  47.27 
 
 
371 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  46.22 
 
 
373 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  47.51 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  44.93 
 
 
396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  48.32 
 
 
373 aa  296  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  43.05 
 
 
369 aa  295  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 
381 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  40.61 
 
 
364 aa  282  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
381 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  41.99 
 
 
368 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  39.27 
 
 
429 aa  270  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  39.83 
 
 
363 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
154 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  47.06 
 
 
158 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
188 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3165  hypothetical protein  32.2 
 
 
367 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  46.81 
 
 
146 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
171 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
170 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
178 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  45.14 
 
 
164 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  45.07 
 
 
159 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
168 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  35.07 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2462  hypothetical protein  28.99 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  42.16 
 
 
109 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.33 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
142 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  29.71 
 
 
150 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  35.71 
 
 
138 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 
156 aa  63.5  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
153 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  32.41 
 
 
141 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  32.41 
 
 
141 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  32.41 
 
 
141 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  32.41 
 
 
141 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  32.41 
 
 
141 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
153 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0227912  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.67 
 
 
154 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
188 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  31.48 
 
 
162 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  31.48 
 
 
141 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  27.66 
 
 
160 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  31.48 
 
 
141 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  31.48 
 
 
141 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  31.48 
 
 
141 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  31.48 
 
 
141 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  31.48 
 
 
141 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.78 
 
 
157 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
153 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  31.48 
 
 
141 aa  57  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
141 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  31.48 
 
 
141 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.15 
 
 
172 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.25 
 
 
154 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
171 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.35 
 
 
176 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.66 
 
 
153 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.83 
 
 
181 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0304  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 
143 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.03 
 
 
176 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.79 
 
 
151 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.54 
 
 
148 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1632  acetyltransferase, GNAT family  29.25 
 
 
155 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 
153 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.9 
 
 
176 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.31 
 
 
183 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.21 
 
 
159 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  30.15 
 
 
159 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  34.94 
 
 
145 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.05 
 
 
189 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1777  acetyltransferase  26.39 
 
 
185 aa  54.3  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  29.41 
 
 
159 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.47 
 
 
175 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3713  acetyltransferase, GNAT family  28.3 
 
 
153 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.87 
 
 
170 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
172 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.94 
 
 
153 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2855  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.28 
 
 
157 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.87 
 
 
163 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.18 
 
 
144 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  29.63 
 
 
155 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
162 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  34.94 
 
 
141 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  34.94 
 
 
141 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  34.94 
 
 
141 aa  53.1  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  33.73 
 
 
141 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.54 
 
 
150 aa  53.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
139 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  29.63 
 
 
155 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>