269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4157 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
396 aa  830    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  55.76 
 
 
373 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  46 
 
 
429 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  47.95 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  47.67 
 
 
365 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  43.32 
 
 
381 aa  322  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  44.81 
 
 
367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  44.93 
 
 
382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.11 
 
 
371 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  43.56 
 
 
368 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  41.92 
 
 
389 aa  288  9e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  40.16 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  43.67 
 
 
364 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  42.54 
 
 
373 aa  269  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  39.01 
 
 
369 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  43.4 
 
 
364 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  39.89 
 
 
368 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  36.86 
 
 
363 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  36.74 
 
 
364 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  47.85 
 
 
194 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  44.22 
 
 
158 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  43.15 
 
 
154 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
154 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
188 aa  97.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3165  hypothetical protein  28.92 
 
 
367 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 
146 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
170 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
178 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
171 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  39.6 
 
 
109 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
168 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
164 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.86 
 
 
153 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
159 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2462  hypothetical protein  26.86 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.05 
 
 
161 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
291 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.45 
 
 
149 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  33.11 
 
 
138 aa  62  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.82 
 
 
153 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.62 
 
 
156 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6547  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.77 
 
 
152 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.52 
 
 
152 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.53 
 
 
146 aa  60.1  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.52 
 
 
170 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2855  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.56 
 
 
157 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 
175 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0630  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.34 
 
 
188 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1253  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.08 
 
 
150 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.11 
 
 
179 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2362  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.05 
 
 
158 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.32 
 
 
161 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32 
 
 
162 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0348  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.39 
 
 
144 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
142 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.27 
 
 
158 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  42.17 
 
 
147 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.75 
 
 
176 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.27 
 
 
158 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.27 
 
 
158 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.14 
 
 
153 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17430  acetyltransferase  40 
 
 
317 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2155  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.82 
 
 
154 aa  54.3  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0068043  hitchhiker  0.000372679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0413  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.58 
 
 
153 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.29 
 
 
151 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.49 
 
 
149 aa  53.5  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  43.28 
 
 
148 aa  53.1  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.87 
 
 
163 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.03 
 
 
148 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29220  acetyltransferase  27.17 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  28.79 
 
 
891 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0916  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.12 
 
 
182 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0563  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.91 
 
 
149 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2567  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.67 
 
 
159 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.203985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.75 
 
 
181 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2472  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.92 
 
 
159 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  0.87758 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2663  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.67 
 
 
159 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51966  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1390  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.03 
 
 
147 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.484383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.87 
 
 
153 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1293  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.86 
 
 
159 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.489062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.23 
 
 
159 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3845  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.54 
 
 
164 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
152 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  34 
 
 
156 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.67 
 
 
162 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.09 
 
 
860 aa  50.8  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
184 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2277  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.44 
 
 
167 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2124  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.15 
 
 
154 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.03 
 
 
147 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2087  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.15 
 
 
154 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.279688  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1381  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
166 aa  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.16 
 
 
150 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.19 
 
 
154 aa  49.7  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1731  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.95 
 
 
156 aa  49.7  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.51 
 
 
147 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
174 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.2 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1763  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
138 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>