22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2462 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2462  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3165  hypothetical protein  35.48 
 
 
367 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
368 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  29.97 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  29.97 
 
 
365 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  27.01 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  31.22 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  26.86 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  28.26 
 
 
194 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.88 
 
 
371 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 
367 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  24.71 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  28.33 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  29.71 
 
 
363 aa  53.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>