22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3165 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3165  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  704    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2462  hypothetical protein  34.65 
 
 
396 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
368 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  34.6 
 
 
389 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  32.68 
 
 
365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  32.68 
 
 
365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  29.56 
 
 
373 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
364 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
373 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
367 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
396 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  33.33 
 
 
364 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  27.8 
 
 
429 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.19 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  26.33 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  28.11 
 
 
194 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  24.39 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  20.56 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  23.31 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  21.72 
 
 
363 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>