123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2649 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 169 aa  340  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3243  acetyltransferase  86.31 
 
 		 169 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2518  GCN5-related N-acetyltransferase  83.64 
 
 		 167 aa  277  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2850  GCN5-related N-acetyltransferase  46.11 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35200  putative acetyltransferase  46.71 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2969  putative acetyltransferase  46.71 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1017  GCN5-related N-acetyltransferase  42.94 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0516  GCN5-related N-acetyltransferase  44.85 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1561  Fis family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2664  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967837  normal  0.139051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3598  GCN5-related N-acetyltransferase  41.28 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4769  GCN5-related N-acetyltransferase  41.28 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5514  GCN5-related N-acetyltransferase  41.28 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0946  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4676  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499819  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4151  GCN5-related N-acetyltransferase  36.94 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5140  GCN5-related N-acetyltransferase  37.13 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3891  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.546651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0496  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358356  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2136  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122562  normal  0.91732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5097  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1357  acetyltransferase  39.26 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2473  acetyltransferase  39.26 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200153  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0341  acetyltransferase  39.26 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0620  acetyltransferase  39.26 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.882351  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1209  acetyltransferase  39.26 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0950  acetyltransferase  39.26 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3507  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1282  acetyltransferase  39.26 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0773193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161188  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1524  acetyltransferase  37.04 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2019  putative acetyltransferase  33.98 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.380338  normal  0.0216614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2379  acetyltransferase  34.15 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0801  acetyltransferase  45.95 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.587739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000447791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4807  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370573  normal  0.130595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5806  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.986614  normal  0.529304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.74 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0661  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.66 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6054  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 286 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.66 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.66 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6350  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 		 286 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.76 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1982  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.62 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.615427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  26.6 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35.9 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4109  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 		 299 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.15 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4083  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.284759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.6 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.6 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.6 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.66 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  20.86 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 326 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2388  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.6 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6280  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 		 286 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0285915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  39.74 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6448  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 		 286 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.863583  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6683  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 		 286 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 		 165 aa  44.3  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1138  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 364 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.73 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  26.14 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  26.14 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  26.13 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34630  acetyltransferase  31.09 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0793  putative acetyltransferase  27.5 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.294913  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0921  putative acetyltransferase  27.5 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.335602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  31.58 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  26.14 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2602  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229806  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.13 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  26.14 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  28.7 
 
 		 172 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.18 
 
 		 152 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1743  acetyltransferase, GNAT family  24.14 
 
 		 152 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1632  acetyltransferase, GNAT family  26.14 
 
 		 155 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00321176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0348  GCN5-related protein N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 156 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>