84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2379 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2379  acetyltransferase  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5140  GCN5-related N-acetyltransferase  60 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2850  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3243  acetyltransferase  37.7 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1561  Fis family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4151  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1017  GCN5-related N-acetyltransferase  39.45 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2518  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4676  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499819  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3598  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5514  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4769  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.546651  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161188  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2969  putative acetyltransferase  36.28 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35200  putative acetyltransferase  35.4 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000447791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0516  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  33.62 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5097  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3891  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0946  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2473  acetyltransferase  33.87 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1357  acetyltransferase  33.87 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0341  acetyltransferase  33.87 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1282  acetyltransferase  33.86 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0773193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1209  acetyltransferase  33.86 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0620  acetyltransferase  33.87 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.882351  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0950  acetyltransferase  33.87 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2136  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122562  normal  0.91732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4480  acetyltransferase, GNAT family  34 
 
 		 277 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3507  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358356  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0801  acetyltransferase  31.68 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.587739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0496  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101337 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2019  putative acetyltransferase  29.46 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.380338  normal  0.0216614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1524  acetyltransferase  33.6 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4807  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370573  normal  0.130595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2664  GCN5-related N-acetyltransferase  47.06 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967837  normal  0.139051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5806  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.986614  normal  0.529304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4800  acetyltransferase  38.24 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  30 
 
 		 2374 aa  44.3  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.58 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0676  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.94 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1927  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.63 
 
 		 860 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02240  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.1 
 
 		 781 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4245  acetyltransferase  29.7 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2132  GCN5-related protein N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03825  GNAT family acetyltransferase Nat4, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08210)  31.62 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4576  acetyltransferase  29.7 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  33.33 
 
 		 891 aa  42  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 		 153 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1390  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.62 
 
 		 147 aa  42  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.484383  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0561  hypothetical protein  41.56 
 
 		 155 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0661  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2407  hypothetical protein  27.72 
 
 		 148 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.565519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 		 279 aa  41.6  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.205056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 		 270 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4428  acetyltransferase, GNAT family  28.71 
 
 		 231 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  38.46 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  38.46 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31200  acetyltransferase  33.67 
 
 		 283 aa  41.6  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  38.46 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3315  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1304  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0256127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326053  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4083  acetyltransferase  28.71 
 
 		 277 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000292268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3031  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2105  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0176775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0265  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 		 160 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 147 aa  41.2  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1379  acetyltransferase  34.43 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000349378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.56 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4429  acetyltransferase  26.8 
 
 		 248 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1846  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0792  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.72 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00131347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>