51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3464 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
162 aa  308  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2136  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122562  normal  0.91732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  48.77 
 
 
181 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000447791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0801  acetyltransferase  51.85 
 
 
171 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.587739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
163 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0496  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0101337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.546651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1561  Fis family transcriptional regulator  38.41 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2969  putative acetyltransferase  34.19 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35200  putative acetyltransferase  34.19 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0661  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2850  GCN5-related N-acetyltransferase  37.35 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358356  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2518  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3243  acetyltransferase  40.21 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376416  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3598  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4769  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5514  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542593  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1017  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5097  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161188  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4676  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499819  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4151  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0946  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5140  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4807  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370573  normal  0.130595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3507  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3891  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
177 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395185  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0516  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
170 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1524  acetyltransferase  39.64 
 
 
201 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2664  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
192 aa  50.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967837  normal  0.139051 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0620  acetyltransferase  38.74 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.882351  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0950  acetyltransferase  38.74 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1357  acetyltransferase  38.74 
 
 
198 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2473  acetyltransferase  38.74 
 
 
198 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200153  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0341  acetyltransferase  38.74 
 
 
198 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1209  acetyltransferase  38.74 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2019  putative acetyltransferase  29.41 
 
 
173 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.380338  normal  0.0216614 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1282  acetyltransferase  38.74 
 
 
184 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0773193  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5806  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
183 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.986614  normal  0.529304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
310 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2379  acetyltransferase  35.29 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2631  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.512633  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 
162 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
350 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2992  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.32 
 
 
156 aa  40.8  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
174 aa  40.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>