56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3780 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3780  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
159 aa  324  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3256  tRNA (Guanine37-N1) methyltransferase  49.37 
 
 
385 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.840049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  46.27 
 
 
372 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  44.78 
 
 
350 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  40.52 
 
 
154 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4387  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1491  GCN5-related N-acetyltransferase  38.85 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  40.43 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  39.55 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28000  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.43 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0943003  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0691  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.743361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1478  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2848  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2992  GCN5-related protein N-acetyltransferase  34.03 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  32.98 
 
 
347 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0042  acetyltransferase  35 
 
 
146 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1979  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000336011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4860  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4794  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
343 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28723  predicted protein  27.64 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.627858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2765  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2853  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2400  GCN5-related protein N-acetyltransferase  31.88 
 
 
161 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  30.93 
 
 
150 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
141 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171947  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1016  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
144 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  39.73 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2814  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  41.27 
 
 
348 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499427  normal  0.0530998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3761  AAA ATPase central domain protein  34 
 
 
438 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
147 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
168 aa  40.8  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  33.71 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
139 aa  40.8  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0313  hypothetical protein  28.45 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>