256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4339 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  87.07 
 
 
166 aa  267  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  80.95 
 
 
148 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  77.24 
 
 
148 aa  229  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  66.44 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  66.67 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  65.07 
 
 
153 aa  193  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  45.8 
 
 
162 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  42.28 
 
 
155 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.757532  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0845  GCN5-related N-acetyltransferase  42.57 
 
 
159 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455582  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2371  GCN5-related N-acetyltransferase  40.69 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  34.03 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  30.34 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.34 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  28.68 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0063  hypothetical protein  30.07 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000827608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  35.06 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195178  normal  0.40215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  30.52 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  30.52 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  30.52 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  29.25 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  29.25 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  28.76 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  29.25 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  24.24 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  29.25 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  29.25 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  28 
 
 
151 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
171 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.810572  normal  0.111735 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  28.19 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
144 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6588  hypothetical protein  39.19 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745421  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  28 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  29.22 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  29.22 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  29.45 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0174  hypothetical protein  27.42 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  35.61 
 
 
146 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
161 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.25 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  37.23 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22280  acetyltransferase  48.39 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3211  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.58 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003788  transcriptional regulator  32.38 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00106887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  27.7 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4266  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.41 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2044  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.41 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
192 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2063  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.41 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.660886 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  32.85 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5353  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1301  acetyltransferase  31.76 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681894  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0900  acetyltransferase  27.34 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1945  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.39 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0897  acetyltransferase  27.34 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001389  spermidine N1-acetyltransferase  28.04 
 
 
180 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.091207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4188  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487702  normal  0.251974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2076  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.66 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.43 
 
 
147 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45980  putative acetyltransferase  27.41 
 
 
143 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
174 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02663  acetyltransferase  29.5 
 
 
171 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
149 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28150  acetyltransferase  31.82 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.94 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2792  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000622629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0634  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.581796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  30.19 
 
 
547 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.76 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  31.06 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>