61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28000  acetyltransferase (GNAT) family protein  100 
 
 
175 aa  356  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0943003  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0691  GCN5-related N-acetyltransferase  86.79 
 
 
160 aa  283  8e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  74.84 
 
 
166 aa  243  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  70.78 
 
 
179 aa  234  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.743361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2992  GCN5-related protein N-acetyltransferase  71.61 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2848  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1491  GCN5-related N-acetyltransferase  47.33 
 
 
160 aa  111  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1478  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
158 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4387  GCN5-related N-acetyltransferase  43.66 
 
 
153 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  41.5 
 
 
155 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  50.38 
 
 
164 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
154 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
160 aa  94.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 
156 aa  87.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
153 aa  87  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3256  tRNA (Guanine37-N1) methyltransferase  40.98 
 
 
385 aa  82  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.840049  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3780  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 
350 aa  61.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  29.77 
 
 
372 aa  58.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3382  acetyltransferase  30 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3057  acetyltransferase  29.23 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000438891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3383  acetyltransferase, GNAT family  29.23 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0909187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3412  acetyltransferase  29.23 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3357  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.89 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3163  acetyltransferase  29.23 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3147  acetyltransferase  29.23 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000022061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3382  acetyltransferase, GNAT family  29.23 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1869  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.6 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3085  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00716598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1979  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
160 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000336011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
166 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1332  GCN5-related N-acetyltransferase  23.45 
 
 
159 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002624  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  29.73 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09760  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.07 
 
 
147 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.257332  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2853  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
166 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4116  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.6 
 
 
338 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
151 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2129  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05633  hypothetical protein  31.11 
 
 
136 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03382  hypothetical protein  27.03 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3196  GCN5-related N-acetyltransferase  23.01 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2641  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02910  Acetyltransferase  26.11 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.810572  normal  0.111735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1830  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase  29.2 
 
 
389 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0222  GCN5-related protein N-acetyltransferase  26.24 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1973  acetyltransferase  26.62 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  26.36 
 
 
295 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1410  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0612  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.7 
 
 
148 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
313 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.043946  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2179  acetyltransferase  22.05 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2224  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
308 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0615  acetyltransferase  27.06 
 
 
154 aa  41.2  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>