25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1996 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1996  acetyltransferase  100 
 
 
178 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  74.72 
 
 
178 aa  284  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00850903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2426  GCN5-related N-acetyltransferase  74.72 
 
 
178 aa  284  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0353286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3996  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0286626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
178 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.549409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
191 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802032  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
191 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126234  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6172  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
191 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0926074 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0109  acetyltransferase  30 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02910  Acetyltransferase  23.81 
 
 
170 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 
170 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1695  acetyltransferase protein  34.31 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120142  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2081  acetyltransferase  36.08 
 
 
295 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1934  acetyltransferase  36.08 
 
 
295 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
312 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  32.98 
 
 
295 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2822  acetyltransferase  22.22 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  24.66 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0645  GCN5-related N-acetyltransferase  25.27 
 
 
196 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0202346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0862  acetyltransferase  36.21 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>