27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3996 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3996  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
180 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0286626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  98.33 
 
 
180 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  70.06 
 
 
178 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.549409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  68.79 
 
 
174 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0109  acetyltransferase  40.91 
 
 
185 aa  139  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
178 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00850903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2426  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
178 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0353286  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1996  acetyltransferase  37.89 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
191 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126234  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
191 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802032  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6172  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
191 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0926074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5140  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02910  Acetyltransferase  23.78 
 
 
170 aa  48.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2666  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4041  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  21.77 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161188  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3135  acetyltransferase, GNAT family  29.13 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.307685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  23.14 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0286  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 
177 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2864  acetyltransferase  28.7 
 
 
170 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  23.19 
 
 
209 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.81 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10902  predicted protein  30.43 
 
 
473 aa  41.2  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  24.56 
 
 
175 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1870  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
158 aa  40.8  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
162 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3481  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341677  normal  0.772984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>