59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1870 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1870  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
158 aa  320  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2916  GCN5-related N-acetyltransferase  67.52 
 
 
158 aa  225  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  60.65 
 
 
158 aa  188  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  60.65 
 
 
160 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02910  Acetyltransferase  26.45 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.268987  normal  0.639753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1739  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00850903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2426  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0353286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3231  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 
139 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000216364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2180  acetyltransferase, GNAT family  30.23 
 
 
295 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
312 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0516  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5784  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0803  putative acetyltransferase  24.09 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.711368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  23.36 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294177  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2539  putative acetyltransferase  23.13 
 
 
155 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2410  putative acetyltransferase  22.63 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358356  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2492  putative acetyltransferase  22.63 
 
 
151 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  21.8 
 
 
209 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1881  putative acetyltransferase  22.63 
 
 
151 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2517  putative acetyltransferase  22.63 
 
 
151 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1934  acetyltransferase  29.63 
 
 
295 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2986  GNAT family acetyltransferase  27.21 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2081  acetyltransferase  29.63 
 
 
295 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  27.08 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1896  acetyltransferase  30.23 
 
 
295 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1443  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
281 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  24.79 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  25.47 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0109  acetyltransferase  26.89 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3189  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  28.92 
 
 
295 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0180  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.218409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  27.78 
 
 
157 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3710  acetyltransferase, GNAT family  24.83 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  24.09 
 
 
156 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.445128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5824  putative acetyltransferase  22.63 
 
 
151 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1983  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 
199 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00080154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0718  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0032  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4688  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  27.71 
 
 
295 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1998  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  22.38 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3252  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  21.68 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3996  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0286626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1491  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  25.84 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34210  acetyltransferase  25 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3115  acetyltransferase, GNAT family  24.84 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>