50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5784 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5784  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
175 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2666  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4041  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
168 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3481  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341677  normal  0.772984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12180  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.28 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3115  acetyltransferase, GNAT family  28.3 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.650543  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3112  acetyltransferase  28.3 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2895  acetyltransferase  28.3 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.425529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2136  acetyltransferase, GNAT family  37.04 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2822  acetyltransferase  33.33 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0928  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.477111  normal  0.744575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2097  hypothetical protein  25.43 
 
 
200 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3101  acetyltransferase, GNAT family  36.11 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3133  acetyltransferase  28.48 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2864  acetyltransferase  25.95 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3522  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
191 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.77056  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3135  acetyltransferase, GNAT family  29.46 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.307685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1285  GCN5-related N-acetyltransferase  23.94 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
229 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  25.36 
 
 
168 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0152  hypothetical protein  30.72 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  25.38 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  26.67 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  26.67 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5108  acetyltransferase, gnat family  22.97 
 
 
173 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  26 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0938  GCN5-related N-acetyltransferase  23.53 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000016136  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0546  acetyltransferase  23.38 
 
 
176 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  unclonable  9.485090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  41.82 
 
 
202 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1870  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
158 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
195 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  29.21 
 
 
295 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14360  acetyltransferase  38.16 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4788  GCN5-related N-acetyltransferase  22.08 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2061  acetyltransferase  37.1 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.93 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2180  acetyltransferase, GNAT family  26.97 
 
 
295 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
166 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.29935  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  28.09 
 
 
295 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  20.51 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
183 aa  41.2  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  20.44 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
149 aa  41.2  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  20.44 
 
 
167 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3797  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>