46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34210  acetyltransferase  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0995  GCN5-related N-acetyltransferase  54.55 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477492  normal  0.167483 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1468  GCN5-related N-acetyltransferase  55.17 
 
 		 202 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01975  acetyltransferase  50.86 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0699749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1312  GCN5-related N-acetyltransferase  50.84 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.449601  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2080  GCN5-related N-acetyltransferase  51.2 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  51.14 
 
 		 431 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867003  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2790  GCN5-related N-acetyltransferase  42.66 
 
 		 237 aa  134  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6930  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  45.96 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0982  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 		 176 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1913  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2266  acetyltransferase, GNAT family  35.43 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1969  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 		 212 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1695  acetyltransferase protein  32.66 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07320  acetyltransferase  37.5 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1983  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 		 199 aa  80.9  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00080154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0897  acetyltransferase  28.39 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0900  acetyltransferase  28.39 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 291 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  37.14 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1323  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000219987  hitchhiker  0.00106714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1561  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.56 
 
 		 291 aa  48.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381847  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4021  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193056  normal  0.623875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.47 
 
 		 294 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2641  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0333  putative acetyltransferase  28.76 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  32.47 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 291 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5899  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.43 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  30.49 
 
 		 295 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05633  hypothetical protein  36.92 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 		 147 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 		 156 aa  41.2  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.445128 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0879  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>