18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0645 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0645  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0202346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  35.46 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000595975  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 		 128 aa  101  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000885364  hitchhiker  0.000586382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0786  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 		 157 aa  99.4  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2715  hypothetical protein  31.43 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000871455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4294  hypothetical protein  26.62 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354309  hitchhiker  0.0000950095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00242  acetyltransferase  26.97 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2878  hypothetical protein  21.6 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002161  predicted acyltransferase  24.09 
 
 		 131 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.839978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3779  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.72634  normal  0.0513749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1331  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4558  acetyltransferase  26.43 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4348  GCN5-related N-acetyltransferase  23.61 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4973  GCN5-like N-acetyltransferase  34 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000872655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 261 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 231 aa  41.6  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1996  acetyltransferase  25.27 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>