51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4396 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
261 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
227 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  51.75 
 
 
228 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  52.05 
 
 
231 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  52.68 
 
 
228 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  46.43 
 
 
247 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  48.89 
 
 
247 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  45.26 
 
 
242 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  45.05 
 
 
224 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  45.13 
 
 
227 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  42.92 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  42.92 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  47.23 
 
 
266 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  42.04 
 
 
238 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  44.54 
 
 
242 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  44.75 
 
 
239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  45.05 
 
 
227 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  46.64 
 
 
238 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
232 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  45.53 
 
 
244 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  42.45 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  40.54 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  42.71 
 
 
213 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  42.15 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
228 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  39.9 
 
 
229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  38.39 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
231 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00415524  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
251 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
166 aa  52  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1619  GCN5-related N-acetyltransferase  26.64 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0329  acetyltransferase  43.86 
 
 
156 aa  48.9  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1685  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0171402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1945  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2194  acetyltransferase, gnat family  33.77 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6861  hypothetical protein  64.71 
 
 
188 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574097  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3204  acetyltransferase  33.77 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1931  acetyltransferase  33.77 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
155 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003207  hypothetical protein  30.5 
 
 
148 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.39966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3230  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25 
 
 
162 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0055  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2180  acetyltransferase, GNAT family protein  33.77 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  37.36 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.64 
 
 
160 aa  42  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0645  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
196 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0202346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>