62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0050 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  59.22 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  61 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  58.16 
 
 		 103 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  59.38 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  59.79 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  60 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  58.59 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  52.04 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  57.45 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  53.61 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  53.61 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  56.82 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  51.04 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  55.68 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  54.12 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  49.47 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  47.47 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  49.45 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  53.49 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  51.09 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  44.9 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  39.56 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  34.09 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  34.09 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.09 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  34.09 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  32.95 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  32.95 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  32.26 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  34.18 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  31.82 
 
 		 110 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  36.59 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  32.89 
 
 		 469 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.14 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.21 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 983 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  41.03 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.56 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.77 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2720  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  40.74 
 
 		 238 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  32.05 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.68 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  32 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  30.77 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2793  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  38.55 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.8 
 
 		 788 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  36.59 
 
 		 573 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.94 
 
 		 452 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  30.23 
 
 		 98 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  32.93 
 
 		 576 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2357  ferredoxin  30.86 
 
 		 284 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.62 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  32.5 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>