59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0066 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0066  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0032  hypothetical protein  88.52 
 
 
61 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.637733  normal  0.748196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0978  hypothetical protein  83.61 
 
 
61 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568203  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  69.39 
 
 
57 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  61.22 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  63.27 
 
 
59 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0681  hypothetical protein  77.05 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  61.11 
 
 
54 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  59.26 
 
 
54 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  61.22 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  59.26 
 
 
54 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0703  hypothetical protein  77.05 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.07802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  62.5 
 
 
53 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  63.27 
 
 
57 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  65.91 
 
 
52 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  59.18 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  55.17 
 
 
54 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  62.5 
 
 
54 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  55.17 
 
 
54 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  61.36 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  51.79 
 
 
58 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  72.22 
 
 
57 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  51.72 
 
 
57 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  62.5 
 
 
57 aa  50.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  61.36 
 
 
54 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  54.17 
 
 
54 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  59.09 
 
 
54 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  62.79 
 
 
54 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  54.17 
 
 
54 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  54.17 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  58.14 
 
 
55 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  61.36 
 
 
51 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  48.28 
 
 
53 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  50.98 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  63.64 
 
 
52 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  50.88 
 
 
57 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  58.33 
 
 
57 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  59.09 
 
 
54 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  74.29 
 
 
57 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3482  protein of unknown function DUF1328  65.79 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740608  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3158  hypothetical protein  65.79 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176198  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1875  hypothetical protein  62.79 
 
 
54 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  48.28 
 
 
56 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  62.16 
 
 
57 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  58.54 
 
 
54 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  56.25 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  53.66 
 
 
58 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  44.83 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  60 
 
 
54 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  53.66 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  56.82 
 
 
57 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5399  hypothetical protein  57.14 
 
 
57 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577848  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  54.29 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 
54 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>