53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3429 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  96.43 
 
 		 57 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  76.79 
 
 		 57 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  68.42 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  58.93 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  64.58 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  54.39 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  52.63 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  56.14 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  62.5 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  71.43 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5399  hypothetical protein  68.57 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  56.14 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  65.71 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3438  hypothetical protein  72.73 
 
 		 57 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.975821  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  52.94 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  47.17 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  50.94 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  52.94 
 
 		 53 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  50.98 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  52.83 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  46.3 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3482  protein of unknown function DUF1328  50.88 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3158  hypothetical protein  50.88 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  38.89 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  47.06 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  46.3 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  48.94 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  41.82 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  45.28 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  42.59 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  42.86 
 
 		 55 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  42.55 
 
 		 52 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  38.89 
 
 		 53 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0263  hypothetical protein  48.98 
 
 		 59 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  44 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  42.55 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  36.36 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  50 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0032  hypothetical protein  61.22 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.637733  normal  0.748196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0681  hypothetical protein  59.38 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  48.08 
 
 		 51 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  44.23 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3842  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.79794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  34.55 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0703  hypothetical protein  59.38 
 
 		 61 aa  40  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.07802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  37.5 
 
 		 57 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>