13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3842 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3842  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.79794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  58.54 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  47.27 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  46.3 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  40.74 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  51.22 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  54.05 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  40.74 
 
 		 54 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  47.17 
 
 		 53 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  53.66 
 
 		 54 aa  40  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  43.9 
 
 		 55 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>