82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5993 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  100 
 
 		 54 aa  94.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  75.47 
 
 		 54 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  75.47 
 
 		 54 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  74.07 
 
 		 54 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  72.22 
 
 		 55 aa  73.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  73.47 
 
 		 56 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  63.46 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  67.92 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  60.38 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  68.09 
 
 		 53 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  68.09 
 
 		 54 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  57.41 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  58.49 
 
 		 54 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  61.11 
 
 		 56 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  62.26 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  56.6 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  56.6 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  65.96 
 
 		 54 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  49.06 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  61.11 
 
 		 52 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  56.6 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1603  hypothetical protein  74.07 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326059  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1656  hypothetical protein  74.07 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  56.6 
 
 		 54 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  65.38 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  56.6 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  65.38 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0341  hypothetical protein  69.81 
 
 		 54 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638525  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  64.44 
 
 		 53 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  58.49 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  64.44 
 
 		 53 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  65.38 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  58.49 
 
 		 54 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  64.44 
 
 		 53 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  64.44 
 
 		 53 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  62.22 
 
 		 54 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  58.49 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  55.77 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10933  hypothetical protein  58.49 
 
 		 53 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  57.14 
 
 		 52 aa  53.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  59.62 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  48.08 
 
 		 58 aa  52.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  60.42 
 
 		 53 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  54.72 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  65.96 
 
 		 58 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  51.92 
 
 		 55 aa  52  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  56.6 
 
 		 51 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  65.96 
 
 		 58 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  65.96 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  60.87 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  59.62 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0835  hypothetical protein  56.25 
 
 		 53 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  57.69 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  55.77 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  55.32 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  59.09 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1875  hypothetical protein  50.94 
 
 		 54 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72370  hypothetical protein  66.67 
 
 		 53 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.160327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6280  hypothetical protein  66.67 
 
 		 53 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0947  hypothetical protein  56.6 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.633529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1091  hypothetical protein  56.6 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  46.81 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  47.06 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0130  hypothetical protein  46.94 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01267  hypothetical protein  64.71 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.106707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4020  hypothetical protein  67.31 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2901  hypothetical protein  66.67 
 
 		 58 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2131  hypothetical protein  63.46 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0139  hypothetical protein  46.94 
 
 		 51 aa  42.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  46 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0112  hypothetical protein  64.71 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5986  hypothetical protein  60.42 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  55.32 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4137  hypothetical protein  58.82 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  45.83 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3712  hypothetical protein  73.47 
 
 		 58 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1463  hypothetical protein  50.94 
 
 		 53 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2977  hypothetical protein  50.94 
 
 		 53 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0338049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2202  hypothetical protein  44.9 
 
 		 51 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  40.43 
 
 		 57 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3464  protein of unknown function DUF1328  58.7 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3842  hypothetical protein  53.66 
 
 		 56 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.79794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>