38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2202 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2202  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0130  hypothetical protein  84.31 
 
 		 51 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0139  hypothetical protein  84 
 
 		 51 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  54.9 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  52.94 
 
 		 53 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0835  hypothetical protein  49.02 
 
 		 53 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  48.98 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  45.83 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  45.1 
 
 		 52 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  54.55 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0991  hypothetical protein  50 
 
 		 52 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0179922  hitchhiker  0.000000000000845091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  48 
 
 		 53 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  44 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  45.45 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  52.27 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  41.82 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  41.07 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  47.27 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  40 
 
 		 57 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  52.27 
 
 		 58 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  44.9 
 
 		 54 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  41.51 
 
 		 125 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  45.45 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  52.27 
 
 		 58 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  47.73 
 
 		 57 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  47.83 
 
 		 54 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  52.27 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  42 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  40.74 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  44 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  44 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  44 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  44 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  40.43 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  46.94 
 
 		 52 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>