53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01748 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  97.4  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  87.5 
 
 		 57 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  51.92 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  48 
 
 		 125 aa  48.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  48 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  48 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  48 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  46.94 
 
 		 53 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  43.64 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  50.98 
 
 		 52 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  48.98 
 
 		 54 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  51.02 
 
 		 54 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  44.64 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  48.08 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  46.55 
 
 		 54 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  59.57 
 
 		 53 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  59.57 
 
 		 53 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  59.57 
 
 		 53 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  59.57 
 
 		 53 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  47.06 
 
 		 54 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  55.56 
 
 		 54 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  48.98 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  46.15 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2202  hypothetical protein  41.07 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  45.45 
 
 		 53 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  44.44 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  42.59 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  53.06 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  41.82 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  41.82 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  46 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  46 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  44 
 
 		 58 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  58.33 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  56.52 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  57.14 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  44 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  42.86 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0835  hypothetical protein  45.45 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0130  hypothetical protein  49.02 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0978  hypothetical protein  59.32 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  44.44 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  49.02 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0139  hypothetical protein  51.06 
 
 		 51 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0681  hypothetical protein  68.75 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  46.94 
 
 		 58 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  40 
 
 		 54 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>