80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0093 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  85.19 
 
 		 54 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  71.7 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  70.37 
 
 		 54 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  72.22 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  70.37 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  64.81 
 
 		 54 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  70.37 
 
 		 54 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  67.92 
 
 		 54 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  66.04 
 
 		 54 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  66.04 
 
 		 54 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1875  hypothetical protein  61.11 
 
 		 54 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  64.15 
 
 		 53 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  60.38 
 
 		 54 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  56.6 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  60.38 
 
 		 54 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  61.22 
 
 		 54 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  54.72 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  58.49 
 
 		 54 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  56.6 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  52.83 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  51.85 
 
 		 53 aa  53.9  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  53.33 
 
 		 52 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1463  hypothetical protein  67.92 
 
 		 53 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2977  hypothetical protein  67.92 
 
 		 53 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0338049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  51.85 
 
 		 58 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  53.7 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  49.06 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  51.85 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  51.85 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  53.7 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  57.14 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  55.1 
 
 		 54 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  51.85 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  51.85 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  53.06 
 
 		 53 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  53.06 
 
 		 53 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  53.06 
 
 		 53 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  53.06 
 
 		 53 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0947  hypothetical protein  61.11 
 
 		 55 aa  50.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.633529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1091  hypothetical protein  61.11 
 
 		 55 aa  50.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5768  hypothetical protein  77.36 
 
 		 53 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 58 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  46.3 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  48.15 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2904  hypothetical protein  66.04 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0341  hypothetical protein  56.6 
 
 		 54 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638525  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  48.98 
 
 		 52 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  64.86 
 
 		 57 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  44.9 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  42.86 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  52.83 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0473  protein of unknown function DUF1328  68.52 
 
 		 54 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2131  hypothetical protein  57.41 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  47.06 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  46.15 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  37.5 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  48 
 
 		 59 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0263  hypothetical protein  51.28 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  44.9 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 57 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  48 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5473  hypothetical protein  69.81 
 
 		 53 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  44 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2202  hypothetical protein  40.74 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  38.89 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2406  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  48.98 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  42.86 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6280  hypothetical protein  60.61 
 
 		 53 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2089  protein of unknown function DUF1328  40.82 
 
 		 76 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0321918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72370  hypothetical protein  60.61 
 
 		 53 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.160327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>