38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3354 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  100 
 
 		 59 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  83.05 
 
 		 59 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  73.68 
 
 		 57 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3158  hypothetical protein  93.22 
 
 		 59 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3482  protein of unknown function DUF1328  93.22 
 
 		 59 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  54.39 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  73.68 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  53.57 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  43.86 
 
 		 57 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  43.86 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5399  hypothetical protein  64.86 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  65.71 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  56.76 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  54.55 
 
 		 53 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  41.82 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  48 
 
 		 54 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  48 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0032  hypothetical protein  60.71 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.637733  normal  0.748196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  45.83 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  44.44 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  40.35 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  54.55 
 
 		 51 aa  43.9  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  46.15 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  52.08 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  50 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3438  hypothetical protein  54.29 
 
 		 57 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.975821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  46 
 
 		 54 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  50 
 
 		 52 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 54 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  47.73 
 
 		 55 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  42.86 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  46 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  46 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  39.29 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  44 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>