77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3438 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3438  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.975821  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  89.29 
 
 		 57 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  84.21 
 
 		 57 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  82.46 
 
 		 57 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5399  hypothetical protein  82.14 
 
 		 57 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  61.54 
 
 		 57 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  56.36 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  64.58 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  61.22 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  59.18 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  51.02 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  61.22 
 
 		 55 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  49.12 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  56 
 
 		 54 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  51.02 
 
 		 53 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  56.25 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  45.1 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  74.29 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  43.86 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  51.06 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  49.09 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  53.06 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  62.16 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  52.94 
 
 		 52 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  51.02 
 
 		 54 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  51.02 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  44.9 
 
 		 53 aa  50.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  48.15 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  55.32 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  53.19 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  42.86 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  47.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  44 
 
 		 57 aa  47.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  44.9 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  44.9 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3482  protein of unknown function DUF1328  57.5 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3158  hypothetical protein  57.5 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  44.9 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  44.9 
 
 		 57 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  47.92 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  47.92 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  51.16 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  51.16 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  51.16 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  51.16 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  44.9 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  44.9 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  46.94 
 
 		 54 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  45.83 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  42.86 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  43.18 
 
 		 54 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  44.9 
 
 		 54 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  45.65 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  45.28 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0112  hypothetical protein  61.36 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4145  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299387  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  48.89 
 
 		 55 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  48.78 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2977  hypothetical protein  54.55 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0338049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0263  hypothetical protein  46 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  47.73 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1463  hypothetical protein  54.55 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1457  hypothetical protein  58.54 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  36.36 
 
 		 58 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0681  hypothetical protein  54.55 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3842  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.79794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  36.73 
 
 		 58 aa  40  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  36.73 
 
 		 58 aa  40  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  36.73 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>