60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2356 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  83.93 
 
 		 57 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  78.95 
 
 		 57 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5399  hypothetical protein  89.29 
 
 		 57 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  65.38 
 
 		 57 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3438  hypothetical protein  82.46 
 
 		 57 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.975821  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  64 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  62 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  56 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  47.37 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  58 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  50.88 
 
 		 59 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  50.91 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  57.14 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  57.14 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  56 
 
 		 54 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  56.25 
 
 		 54 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  47.27 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  64.86 
 
 		 57 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  46.3 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  59.46 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  41.18 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3482  protein of unknown function DUF1328  57.5 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3158  hypothetical protein  57.5 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  48.98 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  47.06 
 
 		 52 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  46.94 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  40.74 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  46.3 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  40.82 
 
 		 53 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  48.94 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  48.94 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  42.86 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  40.43 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  38 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  38 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  51.22 
 
 		 51 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  40.82 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  48.78 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  40.82 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4145  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299387  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  40.82 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  40.82 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  40.82 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  40 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3842  hypothetical protein  45.83 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.79794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  36 
 
 		 54 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  40.82 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  41.46 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0112  hypothetical protein  54.55 
 
 		 57 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1104  protein of unknown function DUF1328  47.06 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  34.69 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0681  hypothetical protein  51.52 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  41.3 
 
 		 56 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>