82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4145 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4145  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299387  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  51.79 
 
 
57 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  61.22 
 
 
53 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  61.4 
 
 
57 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  60 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  48.21 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  64.71 
 
 
52 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  60.71 
 
 
57 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  59.62 
 
 
57 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  57.14 
 
 
54 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  56.25 
 
 
72 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  63.64 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  59.09 
 
 
54 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  69.23 
 
 
54 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  59.09 
 
 
54 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  61.22 
 
 
54 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  60 
 
 
58 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  52.63 
 
 
59 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  61.22 
 
 
57 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0978  hypothetical protein  65.57 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  62.79 
 
 
53 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  62.79 
 
 
53 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  53.06 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5399  hypothetical protein  52.73 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577848  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  62.79 
 
 
53 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  65.85 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  50 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  64.1 
 
 
56 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  65.12 
 
 
54 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  66.67 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  62.79 
 
 
53 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  64.86 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3158  hypothetical protein  66.67 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176198  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3482  protein of unknown function DUF1328  66.67 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740608  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  53.06 
 
 
57 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  49.02 
 
 
58 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  53.06 
 
 
56 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0681  hypothetical protein  66.67 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1457  hypothetical protein  63.64 
 
 
81 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  53.06 
 
 
57 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  54 
 
 
53 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_004310  BR1656  hypothetical protein  65.12 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87763  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  51.02 
 
 
57 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  55.1 
 
 
57 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  62.86 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1603  hypothetical protein  65.12 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  55.1 
 
 
57 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  62.5 
 
 
54 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  52.94 
 
 
54 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  62.5 
 
 
51 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  46.55 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  60 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  60 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  65 
 
 
52 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  52.08 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0703  hypothetical protein  71.88 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.07802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  53.06 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  48 
 
 
57 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  55 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  51.02 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5986  hypothetical protein  55.26 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2901  hypothetical protein  72.73 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  60 
 
 
54 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3438  hypothetical protein  50 
 
 
57 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.975821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  50.94 
 
 
54 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0032  hypothetical protein  62.3 
 
 
61 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.637733  normal  0.748196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2659  protein of unknown function DUF1328  67.5 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96106  normal  0.574367 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0130  hypothetical protein  56.82 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  57.14 
 
 
57 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  47.27 
 
 
58 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  47.27 
 
 
58 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  57.5 
 
 
54 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1511  hypothetical protein  77.5 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0139  hypothetical protein  56.82 
 
 
51 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  47.27 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  47.27 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6280  hypothetical protein  69.7 
 
 
53 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  53.33 
 
 
53 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72370  hypothetical protein  69.7 
 
 
53 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.160327  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2202  hypothetical protein  53.19 
 
 
51 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  45.45 
 
 
55 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>