55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2934 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  94.64 
 
 		 57 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5399  hypothetical protein  83.93 
 
 		 57 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3438  hypothetical protein  84.21 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.975821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  78.95 
 
 		 57 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  57.69 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  62.5 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  54.55 
 
 		 58 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  61.22 
 
 		 57 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  53.06 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  50.88 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  55.1 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  70.27 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  64.86 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  52.73 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  51.02 
 
 		 55 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  44.9 
 
 		 53 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  43.86 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  46 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  41.18 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  45.83 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  46.81 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  48.98 
 
 		 58 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3482  protein of unknown function DUF1328  57.5 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3158  hypothetical protein  57.5 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  48.94 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  42.86 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  38.78 
 
 		 53 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  42.86 
 
 		 54 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  40.74 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  41.18 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  40.82 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  40.82 
 
 		 54 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  40.82 
 
 		 54 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  40 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  40.82 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  38.89 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  35.19 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  43.18 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  43.48 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  40.43 
 
 		 54 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  41.67 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  41.67 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  39.58 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  35.19 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0263  hypothetical protein  35.71 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  41.86 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  48.72 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  41.86 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  41.86 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  41.86 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>